Na teret mu se stavljaju zločini počinjeni 1999. godine nad albanskim zatvorenicima u gradu Kukešu.
Optužen je po četiri tačke za lišavanje slobode, okrutno postupanje, mučenje i ubistvo. Tužilaštvo je tražilo kaznu zatvora od 28 godina.
U optužnice se navodi da su zatvorenici u fabrici metala u gradu Kukešu na severu Albanije fizički maltretirani, te da je na njih pucano, a tokom jednog malteretiranja jedan od zatvorenika je preminuo.
Sa druge strane, odbrana tvrdi da je za 43 dana suđenja uspela da dokaže da se zločini nisu ni dogodili, kao i da Šalja nije kriv.
